Retrouver les origines du SARS-COV-2 dans les phylogénies de coronavirus - IRD - Institut de recherche pour le développement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Médecine/Sciences Année : 2020

Tracing the origins of SARS-COV-2 in coronavirus phylogenies

Retrouver les origines du SARS-COV-2 dans les phylogénies de coronavirus

Résumé

SARS-CoV-2 is a new human coronavirus (CoV). It emerged in China in late 2019 and is responsible for the global COVID-19 pandemic that caused more than 340,000 deaths in four months. Understanding the origin of this virus is an important issue and it is necessary to determine the mechanisms of its dissemination in order to contain future epidemics. Based on phylogenetic inferences, sequence analysis and structure-function relationships of coronavirus proteins, informed by the knowledge currently available on the virus, we discuss the different scenarios evoked to account for the origin - natural or synthetic - of the virus. Based on available data, it is currently impossible to firmly assert whether SARS-CoV2 results from a natural zoonotic emergence or from an accidental escape of a laboratory strain. Regardless of its origin, studying the evolution of the molecular mechanisms involved in the emergence of this pandemic virus is essential to develop therapeutic and vaccine strategies.
Le SARS-CoV-2 est un nouveau coronavirus (CoV) humain. Il a émergé en Chine fin 2019 et est responsable de la pandémie mondiale de COVID-19 qui a causé plus de 340 000 décès en quatre mois. La compréhension de l’origine de ce virus est une question importante et il est nécessaire de déterminer les mécanismes de sa dissémination afin de pouvoir se prémunir de nouvelles épidémies. En nous fondant sur des inférences phylogénétiques, l’analyse des séquences et les relations structure-fonction des protéines de coronavirus, éclairées par les connaissances actuellement disponibles sur le virus, nous discutons les différents scénarios évoqués pour rendre compte de l'origine – naturelle ou synthétique – du virus. L'article est en libre accès sur le site de Médecine/Sciences (https://doi.org/10.1051/medsci/2020123). Une traduction en anglais est disponible sur HAL (https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02891455).
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hal-02891455 , version 1 (06-07-2020)
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hal-02891455 , version 2 (16-07-2020)
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hal-02891455 , version 7 (06-08-2020)
hal-02891455 , version 4 (22-08-2020)
hal-02891455 , version 8 (24-11-2020)

Licence

Paternité - Pas d'utilisation commerciale

Identifiants

  • HAL Id : hal-02891455 , version 1

Citer

Erwan Sallard, Jose Halloy, Didier Casane, Jacques van Helden, Etienne Decroly. Retrouver les origines du SARS-COV-2 dans les phylogénies de coronavirus. Médecine/Sciences, A paraître, Août-Septembre 2020, 36 (8-9). ⟨hal-02891455v1⟩
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