Species delimitation algorithms applied to a large CO1 barcode dataset of lanternfish Diaphus spp - IRD - Institut de recherche pour le développement Accéder directement au contenu
Rapport (Rapport De Recherche) Année : 2022

Species delimitation algorithms applied to a large CO1 barcode dataset of lanternfish Diaphus spp

Résumé

Here, we present a maximum-likelihood tree of 627 partial CO1 gene sequences of lanternfish, Diaphus spp., including 198 new sequences from the Tropical Southwestern Pacific marine bioregion. The tree is in ultrametric format, against which we present the results of species delimitation using the ABGD, GMYC, PTP and mPTP algorithms. Sixty operational taxonomic units or "species" were determined, of which 25 included haplotypes newly sampled from the Tropical Southwestern Pacific.
Fichier sous embargo
Fichier sous embargo
0 9 0
Année Mois Jours
Avant la publication
samedi 8 février 2025
Fichier sous embargo
samedi 8 février 2025
Connectez-vous pour demander l'accès au fichier

Dates et versions

ird-03634906 , version 1 (08-04-2022)

Identifiants

  • HAL Id : ird-03634906 , version 1

Citer

Laurent Millet, Damien Lagrange, Philippe Borsa. Species delimitation algorithms applied to a large CO1 barcode dataset of lanternfish Diaphus spp. [Research Report] Institut de recherche pour le déveoppement. 2022. ⟨ird-03634906⟩

Collections

IRD CNRS LARA UNC
156 Consultations
40 Téléchargements

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More